CLEC7A

CLEC7A
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2BPD, 2BPE, 2BPH, 2CL8
Ідентифікатори
Символи	CLEC7A, BGR, CANDF4, CLECSF12, DECTIN1, CD369, SCARE2, C-type lectin domain family 7 member A, C-type lectin domain containing 7A
Зовнішні ІД	OMIM: 606264 MGI: 1861431 HomoloGene: 49606 GeneCards: CLEC7A
Пов'язані генетичні захворювання
	chronic mucocutaneous candidiasis
Онтологія гена
Молекулярна функція	• MHC protein binding; • GO:0008329 pattern recognition receptor activity; • зв’язування з іоном металу; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • carbohydrate binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • integral component of membrane; • внутрішньоклітинна мембранна органела; • мембрана; • клітинна мембрана; • нуклеоплазма;
Біологічний процес	• cell recognition; • процес імунної системи; • carbohydrate mediated signaling; • phagocytosis, recognition; • inflammatory response; • T cell activation; • defense response to protozoan; • pattern recognition receptor signaling pathway; • вроджений імунітет; • positive regulation of protein-containing complex assembly; • positive regulation of interleukin-1 beta production; • positive regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process; • positive regulation of phagocytosis; • positive regulation of killing of cells of other organism; • positive regulation of cytokine production involved in inflammatory response;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	64581
	56644
	ENSG00000172243
	ENSMUSG00000079293
	Q9BXN2
	V9GXI5
NM_022570; NM_197947; NM_197948; NM_197949; NM_197950;
	NM_197951; NM_197952; NM_197953; NM_197954
	NM_020008; NM_001309637
NP_072092; NP_922938; NP_922939; NP_922940; NP_922941;
	NP_922945
	NP_001296566; NP_064392
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

CLEC7A (англ. C-type lectin domain containing 7A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 247 амінокислот, а молекулярна маса — 27 627^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEYHPDLENL	DEDGYTQLHF	DSQSNTRIAV	VSEKGSCAAS	PPWRLIAVIL
GILCLVILVI	AVVLGTMAIW	RSNSGSNTLE	NGYFLSRNKE	NHSQPTQSSL
EDSVTPTKAV	KTTGVLSSPC	PPNWIIYEKS	CYLFSMSLNS	WDGSKRQCWQ
LGSNLLKIDS	SNELGFIVKQ	VSSQPDNSFW	IGLSRPQTEV	PWLWEDGSTF
SSNLFQIRTT	ATQENPSPNC	VWIHVSVIYD	QLCSVPSYSI	CEKKFSM

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет, запальна відповідь, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, лектинами. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані.

Література

Yokota K., Takashima A., Bergstresser P.R., Ariizumi K. (2001). Identification of a human homologue of the dendritic cell-associated C-type lectin-1, dectin-1. Gene. 272: 51—60. PMID 11470510 doi:10.1016/S0378-1119(01)00528-5
Hermanz-Falcon P., Arce I., Roda-Navarro P., Fernandez-Ruiz E. (2001). Cloning of human DECTIN-1, a novel C-type lectin-like receptor gene expressed on dendritic cells. Immunogenetics. 53: 288—295. PMID 11491532 doi:10.1007/s002510100326
Willment J.A., Gordon S., Brown G.D. (2001). Characterization of the human beta-glucan receptor and its alternatively spliced isoforms. J. Biol. Chem. 276: 43818—43823. PMID 11567029 doi:10.1074/jbc.M107715200
Gruenebach F., Weck M.M., Reichert J., Brossart P. (2002). Molecular and functional characterization of human Dectin-1. Exp. Hematol. 30: 1309—1315. PMID 12423684 doi:10.1016/S0301-472X(02)00928-1
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з CLEC7A переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14558 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q9BXN2 (англ.) . Архів оригіналу за 31 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 12

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Захворювання, генетично пов'язані з CLEC7A переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14558 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-5] UniProt, Q9BXN2 (англ.) . Архів оригіналу за 31 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]