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Clustal

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CLUSTAL
開發者
當前版本1.2.2 (2016年7月1日,​8年前​(2016-07-01)
程式語言C++
作業系統UNIXLinuxMacOSMicrosoft WindowsFreeBSDDebian
類型生物信息學工具
許可協議GNU General Public License, version 2[1]
網站www.clustal.org/omega/
由ClustalW執行的多種生物CDK4蛋白多重序列比對,箭頭指出位置為點突變

Clustal是一類用於多重序列比對生物信息學電腦程式[2]

版本

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Clustal軟體有如下幾個版本:

  • Clustal:最早的版本,由德斯蒙德·G·希金斯在1988年發表[3]
  • ClustalV:Clustal的第二個版本,1992年發布[4]
  • ClustalW:Clustal的第三個版本,1994年發布[3]
  • ClustalX:Clustal的第四個版本,1997年發布[5]
  • Clustal2:Clustal的第五個版本,2007年發布[6]
  • ClustalΩ:Clustal的第六個版本,2011年發布[7][8]

參考資料

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  1. ^ See file COPYING, in source archive [1]頁面存檔備份,存於網際網路檔案館). Accessed 2014-01-15.
  2. ^ Chenna R; Sugawara H; Koike T; Lopez R; Gibson TJ; Higgins DG; Thompson JD. Multiple sequence alignment with the Clustal series of programs. Nucleic Acids Research. July 2003, 31 (13): 3497–500. PMC 168907可免費查閱. PMID 12824352. doi:10.1093/nar/gkg500. 
  3. ^ 3.0 3.1 Higgins DG, Sharp PM. CLUSTAL: a package for performing multiple sequence alignment on a microcomputer. Gene. December 1988, 73 (1): 237–44. PMID 3243435. doi:10.1016/0378-1119(88)90330-7. 
  4. ^ Higgins DG, Bleasby AJ, Fuchs R. CLUSTAL V: improved software for multiple sequence alignment. Computer Applications in the Biosciences. April 1992, 8 (2): 189–91. PMID 1591615. doi:10.1093/bioinformatics/8.2.189. 
  5. ^ Thompson JD; Gibson TJ; Plewniak F; Jeanmougin F; Higgins DG. The CLUSTAL_X windows interface: flexible strategies for multiple sequence alignment aided by quality analysis tools. Nucleic Acids Research. December 1997, 25 (24): 4876–82. PMC 147148可免費查閱. PMID 9396791. doi:10.1093/nar/25.24.4876. 
  6. ^ Dineen, David. Clustal W and Clustal X Multiple Sequence Alignment. www.clustal.org. [2018-04-24]. (原始內容存檔於2018-04-16). 
  7. ^ Sievers F, Higgins DG. Clustal Omega, Accurate Alignment of Very Large Numbers of Sequences. Russell DJ (編). Multiple Sequence Alignment Methods. Methods in Molecular Biology 1079. Humana Press. 2014-01-01: 105–116. ISBN 9781627036450. PMID 24170397. doi:10.1007/978-1-62703-646-7_6 (英語). 
  8. ^ Sievers F, Higgins DG. Clustal Omega 48. John Wiley & Sons, Inc. 2002-01-01: 3.13.1–16. ISBN 9780471250951. PMID 25501942. S2CID 1762688. doi:10.1002/0471250953.bi0313s48 (英語).  |journal=被忽略 (幫助)

外部連結

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