LDB1

LDB1
بنى متوفرة
بنك بيانات البروتين	Ortholog search: PDBe RCSB
قائمة رموز معرفات بنك بيانات البروتين
	2XJY, 2XJZ, 2YPA
معرفات
أسماء بديلة	LDB1, CLIM2, NLI, CLIM-2, LDB-1, LIM domain binding 1
معرفات خارجية	الوراثة المندلية البشرية عبر الإنترنت 603451 MGI: MGI:894762 HomoloGene: 2891 GeneCards: 8861
علم الوجود الجيني
وظائف جزيئية	• ربط دي إن إي; • protein homodimerization activity; • ‏GO:0001106 transcription corepressor activity; • LIM domain binding; • chromatin binding; • protein self-association; • ‏GO:0001948، ‏GO:0016582 ربط بروتيني; • ‏GO:0001158 cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • enzyme binding; • ‏GO:0001104 transcription coregulator activity;
مكونات خلوية	• transcription regulator complex; • نواة; • cell leading edge; • بلازم نووي; • beta-catenin-TCF complex; • ‏GO:0009327 protein-containing complex;
عمليات حيوية	• hair follicle development; • transcription-dependent tethering of RNA polymerase II gene DNA at nuclear periphery; • epithelial structure maintenance; • ‏GO:0009373 ضبط نسخ الدنا; • positive regulation of hemoglobin biosynthetic process; • somatic stem cell population maintenance; • ‏GO:0044324، ‏GO:0003256، ‏GO:1901213، ‏GO:0046019، ‏GO:0046020، ‏GO:1900094، ‏GO:0061216، ‏GO:0060994، ‏GO:1902064، ‏GO:0003258، ‏GO:0072212 ضبط النسخ انطلاقاً من محفز بوليميراز الرنا الثاني; • gastrulation with mouth forming second; • cerebellar Purkinje cell differentiation; • regulation of DNA-templated transcription, elongation; • head development; • histone H3-K4 acetylation; • بروتين دبيلو.أن.تي; • transcription by RNA polymerase II; • نسخ الدنا; • cerebellum development; • negative regulation of erythrocyte differentiation; • نمو متعدد الخلايا; • neuron differentiation; • anterior/posterior axis specification; • cellular component assembly; • ‏GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated; • ‏GO:0003257، ‏GO:0010735، ‏GO:1901228، ‏GO:1900622، ‏GO:1904488 ضبط زيادي للنسخ انطلاقا من محفز بوليميراز الرنا الثاني; • positive regulation of cell adhesion; • regulation of focal adhesion assembly; • regulation of cell migration; • regulation of kinase activity; • regulation of hematopoietic stem cell differentiation; • ‏GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II;
	المصادر:Amigo / QuickGO
نمط التعبير عن الحمض النووي الريبوزي
	; ;
	المزيد من بيانات التعبير المرجعية
تماثلات متسلسلة
	Q86U70
	P70662
	‏NM_003893، ‏NM_001321612، ‏XM_017016867، ‏XM_017016868، ‏XM_017016869، ‏XR_001747255، ‏XM_047425979، ‏XM_047425980 NM_001113407، ‏NM_003893، ‏NM_001321612، ‏XM_017016867، ‏XM_017016868، ‏XM_017016869، ‏XR_001747255، ‏XM_047425979، ‏XM_047425980
	‏NM_010697، ‏XM_006526723، ‏NM_001360336، ‏XM_030250759، ‏XM_030250760، ‏XM_036161453 NM_001113408، ‏NM_010697، ‏XM_006526723، ‏NM_001360336، ‏XM_030250759، ‏XM_030250760، ‏XM_036161453
	‏NP_001308541، ‏NP_003884، ‏XP_016872356، ‏XP_016872357، ‏XP_016872358 NP_001106878، ‏NP_001308541، ‏NP_003884، ‏XP_016872356، ‏XP_016872357، ‏XP_016872358
	‏NP_034827، ‏XP_006526786، ‏NP_001347265، ‏XP_030106619، ‏XP_030106620، ‏XP_036017346 NP_001106879، ‏NP_034827، ‏XP_006526786، ‏NP_001347265، ‏XP_030106619، ‏XP_030106620، ‏XP_036017346
	ويكي بيانات
اعرض/عدّل إنسان	اعرض/عدّل فأر

LDB1‏ (LIM domain binding 1) هوَ بروتين يُشَفر بواسطة جين LDB1 في الإنسان.^[1]^[2]^[3]

التفاعل

لقد ثبت أن LDB1 يتفاعل مع بروتينات أخرى مثل LMO4^[4]^[5] وTCF3^[6] وTAL1^[6] وCBFA2T3.^[6]

المراجع

^ Yamashita T، Agulnick AD، Copeland NG، Gilbert DJ، Jenkins NA، Westphal H (أبريل 1998). "Genomic structure and chromosomal localization of the mouse LIM domain-binding protein 1 gene, Ldb1". Genomics. ج. 48 ع. 1: 87–92. DOI:10.1006/geno.1997.5163. PMID:9503020.
^ "Entrez Gene: LDB1 LIM domain binding 1". مؤرشف من الأصل في 2010-12-05.
^ Semina EV، Altherr MR، Murray JC (ديسمبر 1998). "Cloning and chromosomal localization of two novel human genes encoding LIM-domain binding factors CLIM1 and CLIM2/LDB1/NLI". Mamm Genome. ج. 9 ع. 11: 921–4. DOI:10.1007/s003359900899. PMID:9799849.
^ Sutherland، Kate D؛ Visvader Jane E؛ Choong David Y H؛ Sum Eleanor Y M؛ Lindeman Geoffrey J؛ Campbell Ian G (أكتوبر 2003). "Mutational analysis of the LMO4 gene, encoding a BRCA1-interacting protein, in breast carcinomas". Int. J. Cancer. ج. 107 ع. 1: 155–8. DOI:10.1002/ijc.11343. ISSN:0020-7136. PMID:12925972. S2CID:20908722.
^ Deane، Janet E؛ Mackay Joel P؛ Kwan Ann H Y؛ Sum Eleanor Y M؛ Visvader Jane E؛ Matthews Jacqueline M (مايو 2003). "Structural basis for the recognition of ldb1 by the N-terminal LIM domains of LMO2 and LMO4". EMBO J. ج. 22 ع. 9: 2224–33. DOI:10.1093/emboj/cdg196. ISSN:0261-4189. PMC:156068. PMID:12727888.
^ ^ا ^ب ^ج Goardon، Nicolas؛ Lambert Julie A؛ Rodriguez Patrick؛ Nissaire Philippe؛ Herblot Sabine؛ Thibault Pierre؛ Dumenil Dominique؛ Strouboulis John؛ Romeo Paul-Henri؛ Hoang Trang (يناير 2006). "ETO2 coordinates cellular proliferation and differentiation during erythropoiesis". EMBO J. ج. 25 ع. 2: 357–66. DOI:10.1038/sj.emboj.7600934. ISSN:0261-4189. PMC:1383517. PMID:16407974.

قراءة متعمقة

Osada H، Grutz GG، Axelson H، وآخرون (1997). "LIM-only protein Lmo2 forms a protein complex with erythroid transcription factor GATA-1". Leukemia. 11 Suppl 3: 307–12. PMID:9209374.
Wadman IA، Osada H، Grütz GG، وآخرون (1997). "The LIM-only protein Lmo2 is a bridging molecule assembling an erythroid, DNA-binding complex which includes the TAL1, E47, GATA-1 and Ldb1/NLI proteins". EMBO J. ج. 16 ع. 11: 3145–57. DOI:10.1093/emboj/16.11.3145. PMC:1169933. PMID:9214632.
Jurata LW، Gill GN (1997). "Functional analysis of the nuclear LIM domain interactor NLI". Mol. Cell. Biol. ج. 17 ع. 10: 5688–98. PMC:232417. PMID:9315627.
Visvader JE، Mao X، Fujiwara Y، وآخرون (1998). "The LIM-domain binding protein Ldb1 and its partner LMO2 act as negative regulators of erythroid differentiation". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. ج. 94 ع. 25: 13707–12. Bibcode:1997PNAS...9413707V. DOI:10.1073/pnas.94.25.13707. PMC:28370. PMID:9391090.
Jurata LW، Pfaff SL، Gill GN (1998). "The nuclear LIM domain interactor NLI mediates homo- and heterodimerization of LIM domain transcription factors". J. Biol. Chem. ج. 273 ع. 6: 3152–7. DOI:10.1074/jbc.273.6.3152. PMID:9452425.{{استشهاد بدورية محكمة}}: صيانة الاستشهاد: دوي مجاني غير معلم (link)
Kenny DA، Jurata LW، Saga Y، Gill GN (1998). "Identification and characterization of LMO4, an LMO gene with a novel pattern of expression during embryogenesis". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. ج. 95 ع. 19: 11257–62. Bibcode:1998PNAS...9511257K. DOI:10.1073/pnas.95.19.11257. PMC:21629. PMID:9736723.
Valge-Archer V، Forster A، Rabbitts TH (1999). "The LMO1 and LDB1 proteins interact in human T cell acute leukaemia with the chromosomal translocation t(11;14)(p15;q11)". Oncogene. ج. 17 ع. 24: 3199–202. DOI:10.1038/sj.onc.1202353. PMID:9872335.
Ueki N، Seki N، Yano K، وآخرون (1999). "Isolation and chromosomal assignment of human genes encoding cofactor of LIM homeodomain proteins, CLIM1 and CLIM2". J. Hum. Genet. ج. 44 ع. 2: 112–5. DOI:10.1007/s100380050120. PMID:10083735.
Drechsler M، Schumacher V، Friedrich S، وآخرون (2000). "Genomic structure, alternative transcripts and chromosome location of the human LIM domain binding protein 1 gene LDB1". Cytogenet. Cell Genet. ج. 87 ع. 1–2: 119–24. DOI:10.1159/000015377. PMID:10640831.
Dreyer SD، Morello R، German MS، وآخرون (2000). "LMX1B transactivation and expression in nail-patella syndrome". Hum. Mol. Genet. ج. 9 ع. 7: 1067–74. DOI:10.1093/hmg/9.7.1067. PMID:10767331.
Sum EY، Peng B، Yu X، وآخرون (2002). "The LIM domain protein LMO4 interacts with the cofactor CtIP and the tumor suppressor BRCA1 and inhibits BRCA1 activity". J. Biol. Chem. ج. 277 ع. 10: 7849–56. DOI:10.1074/jbc.M110603200. PMID:11751867.{{استشهاد بدورية محكمة}}: صيانة الاستشهاد: دوي مجاني غير معلم (link)
Ostendorff HP، Peirano RI، Peters MA، وآخرون (2002). "Ubiquitination-dependent cofactor exchange on LIM homeodomain transcription factors". Nature. ج. 416 ع. 6876: 99–103. Bibcode:2002Natur.416...99O. DOI:10.1038/416099a. PMID:11882901.
Deane JE، Visvader JE، Mackay JP، Matthew JM (2003). "1H, 15N and 13C assignments of FLIN4, an intramolecular LMO4:ldb1 complex". J. Biomol. NMR. ج. 23 ع. 2: 165–6. DOI:10.1023/A:1016363414644. PMID:12153047.
Chen L، Segal D، Hukriede NA، وآخرون (2002). "Ssdp proteins interact with the LIM-domain-binding protein Ldb1 to regulate development". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. ج. 99 ع. 22: 14320–5. Bibcode:2002PNAS...9914320C. DOI:10.1073/pnas.212532399. PMC:137882. PMID:12381786.
Strausberg RL، Feingold EA، Grouse LH، وآخرون (2003). "Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. ج. 99 ع. 26: 16899–903. Bibcode:2002PNAS...9916899M. DOI:10.1073/pnas.242603899. PMC:139241. PMID:12477932.
van Meyel DJ، Thomas JB، Agulnick AD (2003). "Ssdp proteins bind to LIM-interacting co-factors and regulate the activity of LIM-homeodomain protein complexes in vivo". Development. ج. 130 ع. 9: 1915–25. DOI:10.1242/dev.00389. PMID:12642495.
Deane JE، Mackay JP، Kwan AH، وآخرون (2003). "Structural basis for the recognition of ldb1 by the N-terminal LIM domains of LMO2 and LMO4". EMBO J. ج. 22 ع. 9: 2224–33. DOI:10.1093/emboj/cdg196. PMC:156068. PMID:12727888.
Marini M، Bongers EM، Cusano R، وآخرون (2004). "Confirmation of CLIM2/LMX1B interaction by yeast two-hybrid screening and analysis of its involvement in nail-patella syndrome". Int. J. Mol. Med. ج. 12 ع. 1: 79–82. DOI:10.3892/ijmm.12.1.79. PMID:12792813.

هذه بذرة مقالة عن بروتين بحاجة للتوسيع. فضلًا شارك في تحريرها.

[pmid9503020-1] Yamashita T، Agulnick AD، Copeland NG، Gilbert DJ، Jenkins NA، Westphal H (أبريل 1998). "Genomic structure and chromosomal localization of the mouse LIM domain-binding protein 1 gene, Ldb1". Genomics. ج. 48 ع. 1: 87–92. DOI:10.1006/geno.1997.5163. PMID:9503020.

[entrez-2] "Entrez Gene: LDB1 LIM domain binding 1". مؤرشف من الأصل في 2010-12-05.

[pmid9799849-3] Semina EV، Altherr MR، Murray JC (ديسمبر 1998). "Cloning and chromosomal localization of two novel human genes encoding LIM-domain binding factors CLIM1 and CLIM2/LDB1/NLI". Mamm Genome. ج. 9 ع. 11: 921–4. DOI:10.1007/s003359900899. PMID:9799849.

[pmid12925972-4] Sutherland، Kate D؛ Visvader Jane E؛ Choong David Y H؛ Sum Eleanor Y M؛ Lindeman Geoffrey J؛ Campbell Ian G (أكتوبر 2003). "Mutational analysis of the LMO4 gene, encoding a BRCA1-interacting protein, in breast carcinomas". Int. J. Cancer. ج. 107 ع. 1: 155–8. DOI:10.1002/ijc.11343. ISSN:0020-7136. PMID:12925972. S2CID:20908722.

[pmid12727888-5] Deane، Janet E؛ Mackay Joel P؛ Kwan Ann H Y؛ Sum Eleanor Y M؛ Visvader Jane E؛ Matthews Jacqueline M (مايو 2003). "Structural basis for the recognition of ldb1 by the N-terminal LIM domains of LMO2 and LMO4". EMBO J. ج. 22 ع. 9: 2224–33. DOI:10.1093/emboj/cdg196. ISSN:0261-4189. PMC:156068. PMID:12727888.

[pmid16407974-6] ا ^ب ^ج Goardon، Nicolas؛ Lambert Julie A؛ Rodriguez Patrick؛ Nissaire Philippe؛ Herblot Sabine؛ Thibault Pierre؛ Dumenil Dominique؛ Strouboulis John؛ Romeo Paul-Henri؛ Hoang Trang (يناير 2006). "ETO2 coordinates cellular proliferation and differentiation during erythropoiesis". EMBO J. ج. 25 ع. 2: 357–66. DOI:10.1038/sj.emboj.7600934. ISSN:0261-4189. PMC:1383517. PMID:16407974.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

التصنيفات الطبية	دليل الوراثة المندلية عند البشر (OMIM): 603451
المعرفات الخارجية	Ensembl Transcript ID: ENST00000673968 نظام اللغة الطبية الموحدة (UMLS CUI): C1416809