LSM7

LSM7
بنى متوفرة
بنك بيانات البروتين	Ortholog search: PDBe RCSB
قائمة رموز معرفات بنك بيانات البروتين
	3JCR
معرفات
أسماء بديلة	LSM7, YNL147W, homolog, U6 small nuclear RNA and mRNA degradation associated
معرفات خارجية	الوراثة المندلية البشرية عبر الإنترنت 607287 MGI: MGI:1913344 HomoloGene: 6781 GeneCards: 51690
علم الوجود الجيني
وظائف جزيئية	• ‏GO:0001948، ‏GO:0016582 ربط بروتيني; • RNA binding; • U6 snRNA binding;
مكونات خلوية	• عصارة خلوية; • catalytic step 2 spliceosome; • spliceosomal tri-snRNP complex; • U6 snRNP; • U12-type spliceosomal complex; • بلازم نووي; • Lsm1-7-Pat1 complex; • spliceosomal complex; • U2-type prespliceosome; • نواة; • U4/U6 x U5 tri-snRNP complex; • U2-type precatalytic spliceosome; • Lsm2-8 complex;
عمليات حيوية	• mRNA splicing, via spliceosome; • ‏GO:0033168، ‏GO:0036404، ‏GO:1902360 معالجة (كيمياء حيوية); • mRNA processing; • exonucleolytic catabolism of deadenylated mRNA; • تضفير الآر أن إيه; • nuclear-transcribed mRNA catabolic process;
	المصادر:Amigo / QuickGO
نمط التعبير عن الحمض النووي الريبوزي
	المزيد من بيانات التعبير المرجعية
تماثلات متسلسلة
	Q9UK45
	Q9CQQ8
	NM_016199
	‏NM_001359148، ‏NM_001359149، ‏NM_001359150 NM_025349، ‏NM_001359148، ‏NM_001359149، ‏NM_001359150
	‏XP_016882358 NP_057283، ‏XP_016882358
	‏NP_001346077، ‏NP_001346078، ‏NP_001346079 NP_079625، ‏NP_001346077، ‏NP_001346078، ‏NP_001346079
	ويكي بيانات
اعرض/عدّل إنسان	اعرض/عدّل فأر

LSM7‏ (LSM7 homolog, U6 small nuclear RNA and mRNA degradation associated) هوَ بروتين يُشَفر بواسطة جين LSM7 في الإنسان.^[1]^[2]^[3]

الوظيفة

تم تحديد بروتينات شبيهة بـ Sm في مجموعة متنوعة من الكائنات الحية بناءً على تشابه تسلسلها مع عائلة بروتينات Sm. تحتوي البروتينات الشبيهة بـ Sm على نمط تسلسل Sm، الذي يتكون من منطقتين يفصل بينهما رابط بطول متغير ينثني على شكل حلقة. يُعتقد أن البروتينات الشبيهة بـ Sm تُشكل هيتروميرًا مستقرًا موجودًا في جزيئات البروتين الريبوزي النووي الصغير الثلاثي، وهي مهمة لربط ما قبل الحمض النووي الريبوزي الرسول.^[4]

التفاعل

لقد ثبت أن LSM7 يتفاعل مع TACC1^[5]^[6] و LSM2.^[7]^[8]

المراجع

^ "Entrez Gene: LSM7 LSM7 homolog, U6 small nuclear RNA associated (S. cerevisiae)". مؤرشف من الأصل في 2010-12-05.
^ Ingelfinger D، Arndt-Jovin DJ، Lührmann R، Achsel T (ديسمبر 2002). "The human LSm1-7 proteins colocalize with the mRNA-degrading enzymes Dcp1/2 and Xrnl in distinct cytoplasmic foci". RNA. ج. 8 ع. 12: 1489–501. DOI:10.1017/S1355838202021726. PMC:1370355. PMID:12515382.
^ Achsel T، Brahms H، Kastner B، Bachi A، Wilm M، Lührmann R (أكتوبر 1999). "A doughnut-shaped heteromer of human Sm-like proteins binds to the 3'-end of U6 snRNA, thereby facilitating U4/U6 duplex formation in vitro". The EMBO Journal. ج. 18 ع. 20: 5789–802. DOI:10.1093/emboj/18.20.5789. PMC:1171645. PMID:10523320.
^ "Entrez Gene: LSM7 LSM7 homolog, U6 small nuclear RNA associated (S. cerevisiae)".
^ Conte N، Delaval B، Ginestier C، Ferrand A، Isnardon D، Larroque C، Prigent C، Séraphin B، Jacquemier J، Birnbaum D (نوفمبر 2003). "TACC1-chTOG-Aurora A protein complex in breast cancer". Oncogene. ج. 22 ع. 50: 8102–16. DOI:10.1038/sj.onc.1206972. PMID:14603251. S2CID:10536264.
^ Conte N، Charafe-Jauffret E، Delaval B، Adélaïde J، Ginestier C، Geneix J، Isnardon D، Jacquemier J، Birnbaum D (أغسطس 2002). "Carcinogenesis and translational controls: TACC1 is down-regulated in human cancers and associates with mRNA regulators". Oncogene. ج. 21 ع. 36: 5619–30. DOI:10.1038/sj.onc.1205658. PMID:12165861.
^ Lehner B، Sanderson CM (يوليو 2004). "A protein interaction framework for human mRNA degradation". Genome Research. ج. 14 ع. 7: 1315–23. DOI:10.1101/gr.2122004. PMC:442147. PMID:15231747.
^ Lehner B، Semple JI، Brown SE، Counsell D، Campbell RD، Sanderson CM (يناير 2004). "Analysis of a high-throughput yeast two-hybrid system and its use to predict the function of intracellular proteins encoded within the human MHC class III region". Genomics. ج. 83 ع. 1: 153–67. DOI:10.1016/S0888-7543(03)00235-0. PMID:14667819.

قراءة متعمقة

Friesen WJ، Dreyfuss G (أغسطس 2000). "Specific sequences of the Sm and Sm-like (Lsm) proteins mediate their interaction with the spinal muscular atrophy disease gene product (SMN)". The Journal of Biological Chemistry. ج. 275 ع. 34: 26370–5. DOI:10.1074/jbc.M003299200. PMID:10851237.{{استشهاد بدورية محكمة}}: صيانة الاستشهاد: دوي مجاني غير معلم (link)
Suzuki H، Fukunishi Y، Kagawa I، Saito R، Oda H، Endo T، Kondo S، Bono H، Okazaki Y، Hayashizaki Y (أكتوبر 2001). "Protein-protein interaction panel using mouse full-length cDNAs". Genome Research. ج. 11 ع. 10: 1758–65. DOI:10.1101/gr.180101. PMC:311163. PMID:11591653.
Eystathioy T، Peebles CL، Hamel JC، Vaughn JH، Chan EK (مارس 2002). "Autoantibody to hLSm4 and the heptameric LSm complex in anti-Sm sera". Arthritis and Rheumatism. ج. 46 ع. 3: 726–34. DOI:10.1002/art.10220. PMID:11920408.
Conte N، Charafe-Jauffret E، Delaval B، Adélaïde J، Ginestier C، Geneix J، Isnardon D، Jacquemier J، Birnbaum D (أغسطس 2002). "Carcinogenesis and translational controls: TACC1 is down-regulated in human cancers and associates with mRNA regulators". Oncogene. ج. 21 ع. 36: 5619–30. DOI:10.1038/sj.onc.1205658. PMID:12165861.
Conte N، Delaval B، Ginestier C، Ferrand A، Isnardon D، Larroque C، Prigent C، Séraphin B، Jacquemier J، Birnbaum D (نوفمبر 2003). "TACC1-chTOG-Aurora A protein complex in breast cancer". Oncogene. ج. 22 ع. 50: 8102–16. DOI:10.1038/sj.onc.1206972. PMID:14603251.
Lehner B، Semple JI، Brown SE، Counsell D، Campbell RD، Sanderson CM (يناير 2004). "Analysis of a high-throughput yeast two-hybrid system and its use to predict the function of intracellular proteins encoded within the human MHC class III region". Genomics. ج. 83 ع. 1: 153–67. DOI:10.1016/S0888-7543(03)00235-0. PMID:14667819.
Lehner B، Sanderson CM (يوليو 2004). "A protein interaction framework for human mRNA degradation". Genome Research. ج. 14 ع. 7: 1315–23. DOI:10.1101/gr.2122004. PMC:442147. PMID:15231747.
Stanĕk D، Neugebauer KM (سبتمبر 2004). "Detection of snRNP assembly intermediates in Cajal bodies by fluorescence resonance energy transfer". The Journal of Cell Biology. ج. 166 ع. 7: 1015–25. DOI:10.1083/jcb.200405160. PMC:2172029. PMID:15452143.

هذه بذرة مقالة عن بروتين بحاجة للتوسيع. فضلًا شارك في تحريرها.

[entrez-1] "Entrez Gene: LSM7 LSM7 homolog, U6 small nuclear RNA associated (S. cerevisiae)". مؤرشف من الأصل في 2010-12-05.

[pmid12515382-2] Ingelfinger D، Arndt-Jovin DJ، Lührmann R، Achsel T (ديسمبر 2002). "The human LSm1-7 proteins colocalize with the mRNA-degrading enzymes Dcp1/2 and Xrnl in distinct cytoplasmic foci". RNA. ج. 8 ع. 12: 1489–501. DOI:10.1017/S1355838202021726. PMC:1370355. PMID:12515382.

[pmid10523320-3] Achsel T، Brahms H، Kastner B، Bachi A، Wilm M، Lührmann R (أكتوبر 1999). "A doughnut-shaped heteromer of human Sm-like proteins binds to the 3'-end of U6 snRNA, thereby facilitating U4/U6 duplex formation in vitro". The EMBO Journal. ج. 18 ع. 20: 5789–802. DOI:10.1093/emboj/18.20.5789. PMC:1171645. PMID:10523320.

[entrez2-4] "Entrez Gene: LSM7 LSM7 homolog, U6 small nuclear RNA associated (S. cerevisiae)".

[pmid14603251-5] Conte N، Delaval B، Ginestier C، Ferrand A، Isnardon D، Larroque C، Prigent C، Séraphin B، Jacquemier J، Birnbaum D (نوفمبر 2003). "TACC1-chTOG-Aurora A protein complex in breast cancer". Oncogene. ج. 22 ع. 50: 8102–16. DOI:10.1038/sj.onc.1206972. PMID:14603251. S2CID:10536264.

[pmid12165861-6] Conte N، Charafe-Jauffret E، Delaval B، Adélaïde J، Ginestier C، Geneix J، Isnardon D، Jacquemier J، Birnbaum D (أغسطس 2002). "Carcinogenesis and translational controls: TACC1 is down-regulated in human cancers and associates with mRNA regulators". Oncogene. ج. 21 ع. 36: 5619–30. DOI:10.1038/sj.onc.1205658. PMID:12165861.

[pmid15231747-7] Lehner B، Sanderson CM (يوليو 2004). "A protein interaction framework for human mRNA degradation". Genome Research. ج. 14 ع. 7: 1315–23. DOI:10.1101/gr.2122004. PMC:442147. PMID:15231747.

[pmid14667819-8] Lehner B، Semple JI، Brown SE، Counsell D، Campbell RD، Sanderson CM (يناير 2004). "Analysis of a high-throughput yeast two-hybrid system and its use to predict the function of intracellular proteins encoded within the human MHC class III region". Genomics. ج. 83 ع. 1: 153–67. DOI:10.1016/S0888-7543(03)00235-0. PMID:14667819.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

التصنيفات الطبية	دليل الوراثة المندلية عند البشر (OMIM): 607287
المعرفات الخارجية	Ensembl Transcript ID: ENST00000591515 نظام اللغة الطبية الموحدة (UMLS CUI): C1426955